Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCANP13611 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCANP13611 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCANP13611 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCANP13611 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCANP13611 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VCANP13611 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCANP13611 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCANP13611 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCANP13611 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCANP13611 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VCANP13611 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCANP13611 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCANP13611 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms