Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM1P13164 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms