Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VPREB1P12018 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VPREB1P12018 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms