Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLUP10909 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLUP10909 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLUP10909 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLUP10909 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLUP10909 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLUP10909 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLUP10909 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLUP10909 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms