Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD1P0DJD0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms