Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA4P06727 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOA4P06727 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA4P06727 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA4P06727 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA4P06727 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA4P06727 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA4P06727 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA4P06727 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOA4P06727 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA4P06727 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms