Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms