Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFNA2P01563 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFNA2P01563 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms