Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL3O95573 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms