Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24AO95486 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms