Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MBD4O95243 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD4O95243 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD4O95243 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD4O95243 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD4O95243 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD4O95243 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD4O95243 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD4O95243 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD4O95243 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD4O95243 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms