Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEBLO76041 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEBLO76041 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEBLO76041 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEBLO76041 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEBLO76041 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEBLO76041 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEBLO76041 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEBLO76041 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEBLO76041 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEBLO76041 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEBLO76041 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEBLO76041 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NEBLO76041 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms