Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN3O75935 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms