Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN15O75808 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN15O75808 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN15O75808 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN15O75808 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN15O75808 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN15O75808 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN15O75808 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN15O75808 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms