Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR5O75473 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR5O75473 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR5O75473 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR5O75473 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR5O75473 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR5O75473 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR5O75473 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR5O75473 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR5O75473 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGR5O75473 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGR5O75473 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGR5O75473 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGR5O75473 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGR5O75473 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGR5O75473 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGR5O75473 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGR5O75473 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LGR5O75473 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGR5O75473 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGR5O75473 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms