Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAMP4O75379 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VAMP4O75379 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms