Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG13O75143 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG13O75143 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG13O75143 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG13O75143 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG13O75143 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG13O75143 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG13O75143 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG13O75143 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG13O75143 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG13O75143 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG13O75143 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG13O75143 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG13O75143 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG13O75143 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG13O75143 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG13O75143 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG13O75143 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG13O75143 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG13O75143 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG13O75143 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG13O75143 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG13O75143 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG13O75143 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG13O75143 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG13O75143 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms