Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE6DO43924 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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