Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms