Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTIFO43310 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTIFO43310 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTIFO43310 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CTIFO43310 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CTIFO43310 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTIFO43310 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTIFO43310 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTIFO43310 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTIFO43310 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTIFO43310 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTIFO43310 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTIFO43310 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTIFO43310 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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