Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC1O15269 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTLC1O15269 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms