Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF6O14896 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF6O14896 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF6O14896 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF6O14896 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF6O14896 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF6O14896 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF6O14896 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF6O14896 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF6O14896 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF6O14896 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF6O14896 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF6O14896 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF6O14896 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF6O14896 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF6O14896 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF6O14896 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF6O14896 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF6O14896 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF6O14896 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF6O14896 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF6O14896 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF6O14896 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF6O14896 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF6O14896 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF6O14896 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF6O14896 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF6O14896 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF6O14896 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF6O14896 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF6O14896 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF6O14896 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF6O14896 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF6O14896 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF6O14896 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF6O14896 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms