Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE40O14503 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHLHE40O14503 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms