Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP56O00567 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOP56O00567 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP56O00567 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP56O00567 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP56O00567 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP56O00567 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP56O00567 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP56O00567 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP56O00567 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP56O00567 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP56O00567 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP56O00567 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP56O00567 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP56O00567 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP56O00567 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP56O00567 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP56O00567 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP56O00567 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP56O00567 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP56O00567 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP56O00567 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP56O00567 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP56O00567 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP56O00567 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP56O00567 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms