Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KPNA3O00505 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KPNA3O00505 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KPNA3O00505 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms