Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3KT08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3KT08 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
J3KT08 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3KT08 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms