Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms