Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOBPA7XYQ1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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