Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6CA6NDK9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms