Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms