Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POTEFA5A3E0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms