Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RGL1-201ENST00000304685 5100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZFP36L1-204ENST00000555997 3094 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NCAM1-226ENST00000619839 2993 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NAA16-202ENST00000403412 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 VRK3-223ENST00000601341 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 FMN1-201ENST00000320930 3930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ITGBL1-205ENST00000545560 4808 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 LSM3-201ENST00000306024 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 AP3B2-201ENST00000261722 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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LSAMPQ13449 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TMEM208-210ENST00000565201 832 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 ACTC1-201ENST00000290378 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LSAMPQ13449 MRPS14-202ENST00000476371 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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