Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3GALT2U3KPV4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
A3GALT2U3KPV4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A3GALT2U3KPV4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms