Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPG1Q9Y678 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPG1Q9Y678 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms