Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FARP1Q9Y4F1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARP1Q9Y4F1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms