Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HCC1Q9Y3T6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms