Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms