Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEU3Q9UQ49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms