Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTF2Q9UNY4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF2Q9UNY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms