Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF18Q9UNG2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms