Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA4Q9UN74 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms