Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSEQ9UL01 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSEQ9UL01 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms