Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms