Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBE1Q9UJT0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBE1Q9UJT0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms