Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSRAQ9UJ68 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms