Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNA1Q9UIW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNA1Q9UIW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA1Q9UIW2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms