Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms