Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A2Q9UI40 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A2Q9UI40 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC24A2Q9UI40 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC24A2Q9UI40 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC24A2Q9UI40 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC24A2Q9UI40 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC24A2Q9UI40 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC24A2Q9UI40 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms