Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R1BQ9UD71 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R1BQ9UD71 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms