Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN8Q9UBY8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms